The contribution of large genomic deletions at the CDKN2A locus to the burden of familial melanoma
Fabienne Lesueur
(1)
,
Mahaut de Lichy
(2)
,
Michel Barrois
(3)
,
Guillermo Durand
(4)
,
Johny Bombled
(5)
,
Marie-Francoise Avril
(6)
,
Agnès Chompret
(7)
,
Françoise Boitier
,
Gilbert M Lenoir
(8)
,
Monique Baccard
(9)
,
Bertrand Bachollet
,
Pascaline Berthet
(10)
,
Valérie Bonadona
,
Jean-Marie Bonnetblanc
(11)
,
Jacqueline Chevrant-Breton
(12)
,
Jean-Francois Cuny,
(13)
,
Stéphane Dalle
(14)
,
Michèle Delaunay
,
Liliane Demange
,
Julie De Quatrebarbes
(15)
,
Jean-François Doré
(16)
,
Marc Frénay
,
Jean-Pierre Fricker
,
Marion Gauthier-Villars
,
Paul Gesta
,
Sophie Giraud
,
Philippe Gorry
(17)
,
Florent Grange
(18)
,
Andrew Green
,
Laetitia Huiart
(19)
,
Nicolas Janin
,
Pascal Joly
,
Delphine Kerob
,
Christine Lasset
(20)
,
Dominique Leroux
,
Jean-Marc Limacher
(21)
,
Michel Longy
,
Sandrine Mansard
(22)
,
Karine Marrou
,
Tanguy Martin-Denavit
,
Christine Mateus
(23)
,
Eve Maubec
(24)
,
Laurence Olivier-Faivre
(25)
,
Vincent Orlandini
,
Pascal Pujol
(26)
,
Bruno Sassolas
(27)
,
Dominique Stoppa-Lyonnet
(28)
,
Luc Thomas
,
Pierre Vabres
(29)
,
Laurence Venat
,
Ewa Wierzbicka
,
Helene Zattara
,
Brigitte Bressac-de Paillerets
(2)
1
GC (FRE2939) -
Génomes et cancer
2 IGR - Institut Gustave Roussy
3 VTG / UMR8121 - Vectorologie et transfert de gènes
4 Service de Génétique [Villejuif]
5 Hématopoïèse normale et pathologique
6 Service de Dermatologie [CHU Cochin]
7 Département de médecine oncologique [Gustave Roussy]
8 UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1
9 Hôpital Michallon
10 UNICANCER/CRLC - Centre Régional de Lutte contre le Cancer François Baclesse [Caen]
11 ERMA - Equipe de Recherche Médicale Appliquée
12 Service de Dermatologie [Rennes] = Dermatology [Rennes]
13 Service de Dermatologie et Allergologie [CHRU Nancy]
14 IGF - Institut de Génomique Fonctionnelle
15 Centre Hospitalier Annecy-Genevois [Saint-Julien-en-Genevois]
16 Oncogénèse et progression tumorale
17 GREThA - Groupe de Recherche en Economie Théorique et Appliquée
18 CHU Reims - Hôpital universitaire Robert Debré [Reims]
19 LIH - Luxembourg Institute of Health
20 Biostatistiques santé [LBBE]
21 Hôpital pasteur [Colmar]
22 CHU Estaing [Clermont-Ferrand]
23 Service de dermatologie
24 Service de dermatologie [Avicenne]
25 Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
26 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
27 DMIP - Brest - Département de Médecine Interne et Pneumologie [Brest]
28 Pathologie moléculaire des cancers
29 Le2i - Laboratoire Electronique, Informatique et Image [UMR6306]
2 IGR - Institut Gustave Roussy
3 VTG / UMR8121 - Vectorologie et transfert de gènes
4 Service de Génétique [Villejuif]
5 Hématopoïèse normale et pathologique
6 Service de Dermatologie [CHU Cochin]
7 Département de médecine oncologique [Gustave Roussy]
8 UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1
9 Hôpital Michallon
10 UNICANCER/CRLC - Centre Régional de Lutte contre le Cancer François Baclesse [Caen]
11 ERMA - Equipe de Recherche Médicale Appliquée
12 Service de Dermatologie [Rennes] = Dermatology [Rennes]
13 Service de Dermatologie et Allergologie [CHRU Nancy]
14 IGF - Institut de Génomique Fonctionnelle
15 Centre Hospitalier Annecy-Genevois [Saint-Julien-en-Genevois]
16 Oncogénèse et progression tumorale
17 GREThA - Groupe de Recherche en Economie Théorique et Appliquée
18 CHU Reims - Hôpital universitaire Robert Debré [Reims]
19 LIH - Luxembourg Institute of Health
20 Biostatistiques santé [LBBE]
21 Hôpital pasteur [Colmar]
22 CHU Estaing [Clermont-Ferrand]
23 Service de dermatologie
24 Service de dermatologie [Avicenne]
25 Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
26 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
27 DMIP - Brest - Département de Médecine Interne et Pneumologie [Brest]
28 Pathologie moléculaire des cancers
29 Le2i - Laboratoire Electronique, Informatique et Image [UMR6306]
Françoise Boitier
- Fonction : Auteur
Bertrand Bachollet
- Fonction : Auteur
Pascaline Berthet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 920652
Valérie Bonadona
- Fonction : Auteur
- PersonId : 912531
Stéphane Dalle
- Fonction : Auteur
- PersonId : 937229
- IdHAL : stephanedalle
- ORCID : 0000-0002-3423-4548
- IdRef : 075987279
Michèle Delaunay
- Fonction : Auteur
Liliane Demange
- Fonction : Auteur
- PersonId : 912529
Marc Frénay
- Fonction : Auteur
- PersonId : 912527
Jean-Pierre Fricker
- Fonction : Auteur
- PersonId : 910039
Marion Gauthier-Villars
- Fonction : Auteur
- PersonId : 907333
Paul Gesta
- Fonction : Auteur
- PersonId : 912528
Sophie Giraud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1359982
- ORCID : 0000-0003-1243-3084
Philippe Gorry
- Fonction : Auteur
- PersonId : 5807
- IdHAL : philippe-gorry
- ORCID : 0000-0002-5497-8069
- IdRef : 136806775
Andrew Green
- Fonction : Auteur
Laetitia Huiart
- Fonction : Auteur
- PersonId : 21438
- IdHAL : laetitia-huiart
- IdRef : 075066696
Nicolas Janin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 907543
Pascal Joly
- Fonction : Auteur
- PersonId : 944960
Delphine Kerob
- Fonction : Auteur
- PersonId : 937573
Christine Lasset
- Fonction : Auteur
- PersonId : 934726
- IdHAL : christine-lasset
- ORCID : 0000-0002-8052-5880
Dominique Leroux
- Fonction : Auteur
- PersonId : 867561
Michel Longy
- Fonction : Auteur
- PersonId : 918895
Karine Marrou
- Fonction : Auteur
Tanguy Martin-Denavit
- Fonction : Auteur
Vincent Orlandini
- Fonction : Auteur
Pascal Pujol
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756985
- ORCID : 0000-0001-8315-4715
Dominique Stoppa-Lyonnet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 770393
- ORCID : 0000-0002-5438-8309
- IdRef : 050298550
Luc Thomas
- Fonction : Auteur
Pierre Vabres
- Fonction : Auteur
- PersonId : 899466
Laurence Venat
- Fonction : Auteur
Ewa Wierzbicka
- Fonction : Auteur
Helene Zattara
- Fonction : Auteur
Résumé
Mutations in two genes encoding cell cycle regulatory proteins have been shown to cause familial cutaneous malignant melanoma (CMM). About 20% of melanoma-prone families bear a point mutation in the CDKN2A locus at 9p21, which encodes two unrelated proteins, p16(INK4a) and p14(ARF). Rare mutations in CDK4 have also been linked to the disease. Although the CDKN2A gene has been shown to be the major melanoma predisposing gene, there remains a significant proportion of melanoma kindreds linked to 9p21 in which germline mutations of CDKN2A have not been identified through direct exon sequencing. The purpose of this study was to assess the contribution of large rearrangements in CDKN2A to the disease in melanoma-prone families using multiplex ligation-dependent probe amplification. We examined 214 patients from independent pedigrees with at least two CMM cases. All had been tested for CDKN2A and CDK4 point mutation, and 47 were found positive. Among the remaining 167 negative patients, one carried a novel genomic deletion of CDKN2A exon 2. Overall, genomic deletions represented 2.1% of total mutations in this series (1 of 48), confirming that they explain a very small proportion of CMM susceptibility. In addition, we excluded a new gene on 9p21, KLHL9, as being a major CMM gene.
| Origine | Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte |
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